补缴社保一般要收滞纳金，滞纳金就是对跨年度的补缴保费行为的一种违约惩罚!
第一，什么是滞纳金?所谓的“滞纳金”含义很广，其实主要就是对不按时缴纳税款、罚款、社保费等涉及到国家强制缴纳款项的一种经济制裁措施。一般是按天计算，以每日万分之五为标准。
这里也可以理解为“违约金”，是指在应缴社保的一个年度内，未及时缴纳社保费;造成个人社保账户欠费断缴期间所产生的违约金，初期的时候主要是针对企业而言，后期由于各种原因断缴欠费较多，也出现了对个人征收的情况。
社保部门在你申请补缴欠费时，会通过时间的长短和欠费额，按照相关规定滞纳金与欠缴社保费一并计收;目的为了确保社保缴费人人平等的公平公正性，维护机制的正常运行。
第二，补缴为什么要收滞纳金?明白了滞纳金的意义后，就应该知道，凡是没有按时缴纳，事后进行补缴的就必须要征收一定的滞纳金。这是因为个人账户余额，社保每年都按将利息支付到当事人账户，那么当事人也必须按照与社保的约定，及时足额缴纳年度社保费。
换一个角度讲，既然你已经在社保开户缴费，就相当于跟社保建立了合同关系，那么，如果你不按时缴纳年度内社保费就必然产生断缴责任，就会造成社保资金支付失衡。那么你在补缴申请时，无论你是企业还是个人?社保就会依据有关规定追究你的违约责任，即在征收补缴保费时加收滞纳金。
第三，如何征收滞纳金?滞纳金的征收的法律依据是《社会保险法》第八十六条规定：
“用人单位未按时足额缴纳社会保险费的，由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金;逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额2到3倍罚款。
对于是否溯及既往的问题，人社部13号令明确指出，按照社会保险法每日承担万分之五滞纳金的规定，仅适用于2011年7月1日社会保险法实施后的行为处理。之前的欠缴行为，按照国家和地方政府的有关规定执行。
综上所述，我认为虽然各地的执行情况不一样，但有两点还是相同的：一是补缴还是要征收滞纳金的。原因是滞纳金就是针对不及时缴纳年度保费，因违约责任导致社保资金收支紧张的一种经济手段。
换句话讲社保费当年度足额缴纳是承保人和被保人的约定，那么，如果断缴后申请补缴就必须承担违约责任，被征收滞纳金。二是年度内交保费，一般不允许加收滞纳金!